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技术与服务

蛋白质磷酸化分析

蛋白质磷酸化分析


服务简介

      翻译后修饰是指由于共价键作用或者某些酶的催化,蛋白质在侧链或者某些位点发生的基团修饰,蛋白质翻译后修饰主要包括乙酰化、磷酸化、泛素化、糖基化等,它们在细胞信号转导等生物过程中起到非常重要的作用。

      磷酸化修饰具有简单、灵活、可逆的特性,以及磷酸基团的供体ATP的易得性,是真核细胞中常见的调控手段。蛋白质的磷酸化和去磷酸化这一可逆过程,几乎调节着包括细胞的增殖、发育、分化、细胞骨架调控、细胞凋亡、神经活动、肌肉收缩、新陈代谢及肿瘤发生等生命活动的所有过程。

      由于磷酸化修饰的蛋白质在生物样本中含量低、动态范围广,利用定量蛋白组学分析手段对富集得到的磷酸化肽段样品进行定量分析前,需要对修饰进行富集从而提高磷酸化修饰蛋白丰度。

技术特点

     1、采用主流的固相金属亲和色谱富集(IMAC),特异性高,富集效率好;

     2、对单磷酸化肽段和多磷酸化肽段进行分步分离,分别进行质谱分析,有利单磷酸化肽段鉴定;

     3、通过高分辨率、高扫描速度的质谱,对富集的磷酸化肽段进行大规模鉴定。

技术流程

      接收样品——蛋白质提取——肽段酶解——磷酸化肽段富集——HPLC分离——LC-MS/MS——数据分析——结果交付

应用领域

     1、药物作用靶点研究

     2、疾病标志物筛选

     3、植物胁迫/抗逆研究

     4、作用机制研究

     5、要求物种具有蛋白质参考数据库、EST序列(转录组)或基因组注释信息

样本要求


表1

     1、蛋白样品:蛋白提取时使用普通的组织、细胞裂解液即可

     2、样品运输:足量干冰运输,尽量选用较快的邮递方式,减少运输过程中样品降解

项目报告

     中英文双语版技术报告,报告包括:
     1、实验步骤(中英文)
     2、相关的质谱参数(中英文)
     3、鉴定的磷酸化位点的详细信息
     4、质谱图片
     5、原始数据

     6、生物信息分析

生物信息分析包括:

     1、修饰蛋白、修饰位点鉴定

     2、鉴定结果特征分布

     3、肽段长度、蛋白覆盖度分布、unique肽段分布

     4、修饰位点motif预测

     5、蛋白质GO功能分类、COG注释、Pathway通路注释

     6、蛋白质网络互作预测(高级分析)

     7、蛋白质Domain预测(高级分析)

     8、蛋白质亚细胞定位(高级分析)

一站式服务

      下单寄送样品,一站式服务完成:样品处理-上机分析-数据分析-项目报告。

服务周期

      自送样起******个工作日。



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