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蛋白质琥珀酰化分析

蛋白质琥珀酰化分析

服务简介 

      翻译后修饰是指由于共价键作用或者某些酶的催化,蛋白质在侧链或者某些位点发生的基团修饰,蛋白质翻译后修饰主要包括乙酰化、磷酸化、泛素化、糖基化等,它们在细胞信号转导等生物过程中起到非常重要的作用。

      蛋白质琥珀酰化修饰是新近发现的一种蛋白质翻译后修饰,是在琥珀酰辅酶 A 的介导下将一个负电荷四碳琥珀酰基转移到赖氨酸残基的伯胺上的过程。赖氨酸琥珀酰化在真核细胞及原核细胞中广泛存在,参与调控包括三羧酸循环,氨基酸代谢以及脂肪酸代谢在内的多个代谢信号通路。琥珀酰化蛋白质组以组织、细胞等较为复杂样本为研究对象,目的在于鉴定样品中发生琥珀酰化修饰的蛋白质以及相应的琥珀酰化修饰位点。

       由于琥珀酰化修饰的蛋白质在生物样本中含量低、动态范围广,质谱分析前需要对琥珀酰化肽段进行富集以提高其丰度,然后利用传统的定量蛋白组分析手段对富集得到的琥珀酰化肽段样品进行定量分析。

技术特点 

     1、采用主流抗体亲和富集方法,特异性高,富集效率好;

     2、通过高分辨率、高扫描速度的质谱,对富集的琥珀酰化肽段进行大规模鉴定;

     3、结合常用的定量技术可对不同样品间的琥珀酰化水平差异进行定量比较。

技术流程

      接收样品——蛋白质提取——肽段酶解——琥珀酰化肽段富集——HPLC分离——LC-MS/MS——数据分析——结果交付

应用领域 

     1、药物作用靶点研究

     2、疾病标志物筛选

     3、植物胁迫/抗逆研究

     4、作用机制研究

     5、要求物种具有蛋白质参考数据库、EST序列(转录组)或基因组注释信息

样本要求 

 

表1

     1、蛋白样品:蛋白提取时使用普通的组织、细胞裂解液即可

     2、样品运输:足量干冰运输,尽量选用较快的邮递方式,减少运输过程中样品降解

项目报告 

     中英文双语版技术报告,报告包括:

     1、实验步骤(中英文)

     2、相关的质谱参数(中英文)

     3、鉴定的琥珀酰化位点的详细信息

     4、质谱图片 

     5、原始数据

     6、生物信息分析

生物信息分析包括:

     1、修饰蛋白、修饰位点鉴定

     2、鉴定结果特征分布

     3、肽段长度、蛋白覆盖度分布、unique肽段分布

     4、修饰位点motif预测

     5、蛋白质GO功能分类、COG注释、Pathway通路注释

     6、蛋白质网络互作预测(高级分析)

     7、蛋白质Domain预测(高级分析)

     8、蛋白质亚细胞定位(高级分析)

一站式服务 

      下单寄送样品,一站式服务完成:样品处理-上机分析-数据分析-项目报告 。

服务周期

      自送样起******个工作日。


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